جذب کوکیوتن بسیار متغیر و وابسته به دریافت غذا و محتوی لیپیدی آن است و جذب در معدهی خالی کمتر بوده و در زمانی که غذا حاوی مقادیر زیادی لیپید است، افزایش می‌یابد. بهترین روش دریافت کوکیوتن همراه وعده غذایی است .
تداخلاتی از مصرف همزمان کیوتن و داروهای ضدانعقاد و کاهنده فشارخون مشاهده شد‌ه‌است. لذا در صورت مصرف این داروها، با پزشک خود در خصوص مصرف این مکمل مشورت کنید. همچنین مصرف کنندگان استاتین‌ها (آتورواستاتین، رزواستاتین و...)، معمولا دچار کمبود Q10 می‌شوند که این کمبود سبب تشدید عارضه منفی تخریب عضلات به دنبال مصرف استاتین‌ها می‌شود. در نتیجه بهتر است، در صورت مصرف این دسته داروها به منظور کاهش دردهای عضلانی ناشی از استاتین‌ها، مصرف کیوتن افزایش یابد
افرادی که دچار انسداد صفراوی و نارسایی کبدی هستند، کسانی که تحت شیمی درمانی و یا رادیوتراپی قرار دارند و افرادی که داروهای ضد فشارخون مصرف می‌کنند باید این محصول را با احتیاط مصرف کنند.
کوآنزیم کیوتن 100 میلی گرمی جالینوس معمولا به خوبی تحمل می‌شود، اما عوارضی مانند تهوع، اسهال، کاهش اشتها و ناراحتی معده به دنبال مصرف دوزهای بالاتر (برابر یا بالاتر از 200 میلی‌گرم روزانه) گزارش شد‌ه‌است.