مصرف مکمل منیزیم عمدتا عارضه خاصی ایجاد نمی کند. فقط دوزهای بالاتر آن می تواند در برخی افراد مشکلات گوارشی مانند اسهال ایجاد کند.
بهترین زمان مصرف این مکمل همراه وعده غذایی است .
منیزیم می تواند جذب برخی داروها از جمله داروهای مورد استفاده در درمان پوکی استخوان (بیس فسفونات ها: آلندرونیت و ...)، برخی آنتی بیوتیک ها (فلوروکینولون ها: سیپروفلوکساسین، لووفلوکساسین و غیره، تتراسیکلین ها و پنی سیلامین)، داروهایی که در درمان بیماری های تیروئیدی استفاده می شود (لووتیروکسین)، گاباپنتین، متابولیت های فعال ویتامین دی و برخی داروهای ضدویروس را تحت تاثیر قرار دهد. در این صورت باید آنها را در زمان دیگری از روز مصرف کرد. جهت مدیریت این تداخلات بهتر است با پزشک یا داروساز خود مشورت کنید. به علاوه مکمل های حاوی منیزیم می توانند اثر فرآورده های حاوی آلفا-لیپوئیک اسید، فسفات و فلوراید را کاهش دهند. این مکمل ها همچنین می توانن
مصرف این مکمل برای بزرگسالان توصیه می شود. با این وجود افراد بالای 9 سال نیز می توانند از این مکمل استفاده کنند.