مصرف دوزهای بالاتر از 3 گرم در روز می تواند باعث تهوع،گرفتگی عضلات و بوی بد بدن شود در ضمن بانوان در دوران بار داری و شیر دهی و افراد مبتلا به تیروئید کم کار مجاز نمی باشد.
به عنوان یک اسید آمینه طبقه بندی می شود و در دسته آمینو اسید های غیر ضروری قرار می گیرد آمینو اسیدها معمولاً توسط بدن برای سنتز پروتئین و یا به عنوان یک انتقال دهنده عصبی استفاده می شوند کارنیتین در درجه اول برای تسهیل انتقال اسیدهای چرب با زنجیره بلند به داخل سلول میتوکندری برای تولید انرژی استفاده می شود که سبب چربی سوزی حداکثری خواهد شد در ضمن کارنیتین برای جلوگیری از تجمع اسیدهای چرب در قلب، کبد و ماهیچه ها نیز مفید است.
کسانی که ورزش می کنند 30 الی 45 دقیقه قبل از تمرینات ورزشی و کسانی که در دوران کاهش وزن هستند می توانند بعد از غذا مصرف کنند.
تحقیقات نشان داده است که مکمل ال-کارنیتین ممکن است باعث کاهش چربی کبد و آنزیم های کبدی (ALT) و (AST) در بیماران مبتلا به بیماری کبد چرب غیر الکلی شود.